Целью деятельности отдела является проведение фундаментальных и прикладных научных исследований, направленных на развитие Севера и арктических территорий Республики Саха (Якутия).
Основными направлениями и задачами отдела являются:

• организация и проведение научных исследований, направленных на развитие Севера и арктических территорий Республики Саха (Якутия);
• организация научных исследований временным творческими коллективами;
• участие в организации мероприятий различного уровня, направленных на решение задач в образовании и науке;
• участие в реализации целей и решении задач в соответствии с Уставом АНИЦ в пределах своей компетенции.

Отдел выполняет следующие основные функции:

• осуществляет текущее и перспективное планирование и прогнозирование своей деятельности;
• проводит теоретические, прикладные и поисковые исследования в соответствии с планами научно-исследовательских работ;
• участвует в научно-образовательной деятельности;
• участвует в популяризации и пропаганде современных подходов, методов исследований и научно-технических достижений в области своей деятельности;
• готовит заявки на участие в конкурсах на получение субсидий и грантов разных уровней;
• подготавливает предложения по развитию материально-технической базы и информационного обеспечения своей деятельности и укреплению социальной защищенности сотрудников отдела.

Главной целью деятельности Музея является организация и про­ ведение фундаментальных и прикладных научных археологических исследований на территории Республики Саха (Якутия) и прилегающих к ней областей, а также учет, комплектование, хранение и экспонирование археологических и музейных коллекций основного и научно-вспомогательного фондов Музея.

Основными задачами и предметом деятельности Музея являются:

• участие в выполнении государственного задания АНИЦ, выполнение годовых планов НИР;
• поиск и изучение археологических памятников на территории Республики Саха (Якутия), а также прилегающих к ней областях для разработки периодизации и хронологии древней и средневековой истории Якутии;
• проведение государственной историко-культурной экспертизы и экспертизы культурных ценностей;
• разработка методики и методологии археологических разведок и рас­ копок в криолитозоне (зоне сплошного распространения многолетнемерзлых пород - «вечной мерзлоты»);
• работы по учету, сохранению, использованию и популяризации объектов культурного наследия на территории Республики Саха (Якутия) и прилегающих к ней областях;
• формирование музейных фондов, организация системы их учета, оформление научной документации (учет, инвентаризация, каталогизация, автоматизация фондов и иные присущие музею функции);
• комплектование и каталогизация музейного архива, научных отчетов, полевой документации, специальной литературы и иные присущие музею функции;
• обеспечение доступа граждан к музейным экспонатам и культурным ценностям, находящихся на балансе Музея и предоставление информации о них путем просветительских, образовательных и выставочных мероприятий, публичного показа археологических и музейных коллекций и экскурсионных мероприятий на платной и бесплатной основе, публикации и распространения информации, содержащих сведения о деятельности Музея и его научно-исследовательских работах, связанных с изучением культурных ценностей в средствах массовой информации, которое осуществляется со­ гласно положению в соответствии с приложением №2 к настоящему Положению;
• участие в научных и музейных мероприятиях, подготовка монографических работ и публикаций в периодических научных и музейных изданиях;
• участие в реализации целей и решении задач в соответствии с Уставом АНИЦ в пределах своей компетенции.